Haemme kahta (2) väitöskirjatutkijaa superresoluutio-mikroskopiaan ja yksittäisten molekyylien seurantaan soluissa

Aalto-yliopisto on rohkeiden ajattelijoiden yhteisö, jossa tiede ja taide kohtaavat tekniikan ja talouden. Tunnistamme ja ratkaisemme yhteiskunnan suuria haasteita ja rakennamme innovatiivista tulevaisuutta. Yliopistossa on kuusi korkeakoulua, lähes 11 000 opiskelijaa ja henkilöstöä noin 4000, joista lähes 400 on professoreita. Pääkampuksemme sijaitsee Espoon Otaniemessä.

Yksittäisten molekyylien dynamiikka soluissa -tutkimusryhmä Aalto-yliopiston Perustieteiden korkeakoulun Neurotieteen ja lääketieteellisen tekniikan laitos hakee  

kahta (2) Väitöskirjatutkijaa superresoluutio-mikroskopiaan ja yksittäisten molekyylien seurantaan soluissa.

Hanke tutkii solujen biofysikaalisia sopeutumismekanismeja ympäristön stressitekijöihin sekä kehittää uusia menetelmiä yksittäisten molekyylien dynamiikan kvantifiointiin ja ymmärtämiseen.

Monet mikro-organismit kestävät ankaria ympäristöolosuhteita, kuten äärilämpötiloja, säilyttäen kuitenkin solunsisäisen tasapainon ja organisaation. Tutkimusta varten käytämme huipputason superresoluutio-mikroskopiaa ja yksittäisten molekyylien seurantamenetelmiä mitataksemme molekyylien liikkettä elävissä soluissa. Molekyylien dynamiikka kertoo niiden välisistä vuorovaikutuksista reaaliajassa ja voi toimia anturina solun sisäisen ympäristön muutoksille. Tämä tieto auttaa meitä ymmärtämään mikro-organismien sopeutumista erilaisiin ympäristöihin ja solupohjaisen elämän rajat. Tutkimus edistää myös synteettisen biologian sovellusten ja uusien analyysiratkaisujen kehitystä.

Tehtävän rooli ja tavoitteet

Etsimme innostuneita ja motivoituneita tohtorikoulutettavia, jotka ovat haluavat kerätä ja/tai analysoida superresoluutio-mikroskopia- ja yksittäisten molekyylien seurantadataa solunsisäisen elämän tutkimiseksi.

Osallistut projektissa seuraaviin osa-alueisiin kiinnostuksesi mukaan: kokeelliseen laboratoriotyöhön, kuvantamiseen TIRF-mikroskoopilla, datan analysointiin, koneoppimiseen ja mallintamiseen. Sovellat olemassa olevia menetelmiä ja kehität uusia menetelmiä sekä protokollia tieteellisen datan keruuseen ja analysointiin eri lähteistä. Tuloksia käytetään hypoteesien testaamiseen ja todentamiseen. Toteutat myös yhteistyöprojekteja ryhmän jäsenten ja muiden yliopistojen tutkijoiden kanssa.

Olet oma-aloitteinen ja itseohjautuva tutkija, joka organisoi projektinsa tehokkaasti ja esittelee tulokset ryhmänsisäisissä ja ulkoisissa kokouksissa ja seminaareissa.

Työskentelet täysipäiväisesti väitöskirjaprojektisi parissa ja suoritat väitöskirjan sekä siihen liittyvät opinnot neljän vuoden kuluessa. Tohtorintutkinto koostuu tutkimusalan erityisopinnoista ja tutkimusprojektista, jonka tulokset julkaistaan vertaisarvioiduissa lehdissä.

Verkostosi ja tiimisi

Neurotieteen ja lääketieteellisen tekniikan laitoksen tutkimus keskittyy lääketieteelliseen tekniikkaan, biofysiikkaan ja aivotutkimukseen. Yhdistämme kokeellisia ja laskennallisia menetelmiä sekä kehitämme algoritmeja ja uusia teknologioita ihmisen hyvinvoinnin ja lääketieteen diagnostiikan ongelmien selvittämiseksi. Kuvaustasot vaihtelevat molekyyli- ja solutasolta ei-invasiiviseen neurokuvantamiseen ja käyttäytymiseen. Koulutamme uuden sukupolven poikkitieteellisiä tutkijoita ja insinöörejä tutustuttamalla heidät huippuluokan tieteeseen ja teknologiaan.

Väitöskirjan ohjaajana toimii Assistant professori Jarno Mäkelä, joka johtaa Yksittäisten molekyylien dynamiikka soluissa -tutkimusryhmää. Monitieteinen tiimimme koostuu mikrobiologian, biokemian, mikroskopian, biofysiikan ja tietojenkäsittelytieteen osaajista. Tiimi mahdollistaa yhteistyöhön perustuvan ympäristön, jossa tutkijat saavat jaettua käytännön kokemusta mikroskopiasta, kokeellisesta laboratoriotyöstä, datan analysoinnista ja mallintamisesta. Työskentelemme useiden aiheiden parissa fysiikan, kemian ja biologian rajapinnassa: solunsisäinen organisaatio, makromolekyylien pakkautuminen, neste-neste-faasierottelu, lämpö- ja kylmäshokkiproteiinien dynamiikka sekä proteomiikka jne. Tutkimusryhmän tarkoituksena tukea ja inspiroida sen jäseniä, antaa akateemista koulutusta ja kehittää keskeisiä taitoja tulevaisuutta varten.

Kokemuksesi ja tavoitteesi /Mitä odotamme sinulta?

• DI:n tai maisterin-tutkinto biofysiikassa, bioteknologiassa, laskennallisessa biologiassa tai muilla vastaavilla aloilla
• Vankka biologian ymmärrys
• Kokemusta vähintään yhdestä seuraavista: fluoresenssimikroskopia, signaalinkäsittely, kuva-analyysi, koneoppiminen tai matemaattinen mallinnus
• Ohjelmointitaidot (Python/Matlab tai vastaava) datan käsittelyyn ja analysointiin
• Kyky ja kiinnostus työskennellä tuloshakuisesti monitieteisessä tiimissä
• Hyvä motivaatio ja periksiantamattomuus haastavien tieteellisten ongelmien ratkaisemiseksi
• Edellytämme erittäin hyvää englanninkielen suullista ja kirjallista taitoa. Suomenkielen taitoa ei edellytetä.

Väitöskirjatutkijalta edellytetään Aalto-yliopiston Perustieteiden tohtoriohjelmaan hakemista ja paikan saamista. Katso lisätiedot täältä https://www.aalto.fi/fi/ohjelmat/perustieteiden-tohtoriohjelma

Mitä tarjoamme sinulle

Tarjoamme sinulle mielenkiintoisen työn inspiroivassa työympäristössä. Pääset työskentelemään yhteisössä, joka panostaa jatkuvaan oppimiseen, yhteistyöhön ja avoimeen viestintään. Perehdytämme sinut tehtäviisi, ja pääset mukaan ystävälliseen ja osaavaan tiimiin, joka auttaa sinua myös tulevaisuudessa.

Väitöskirjatutkijan työsuhteen kokonaispituus on tyypillisesti neljä (4) vuotta. Aallon väitöskirjatutkijoiden työsopimus tehdään ensin kahdeksi vuodeksi jonka jälkeen väitöskirjatyön etenemistä tarkastellaan. Mikäli väitöskirjatyö arvoidaan edenneen suotuisasti, jatkosopimus laaditaan kahdeksi vuodeksi.

Aalto-yliopiston tutkimushenkilöstö noudattaa kokonaistyöaikaa, joka on 1612 tuntia vuodessa.

Pyrimme yhdistämään etä- ja lähityöskentelyn parhaat puolet ja meillä on joustavat työajat. Lähityöpisteesi sijaitsee uudistuneella ja elävällä Otaniemen kampusalueella Espoossa, jossa on monipuoliset palvelut ja hyvät kulkuyhteydet metron, uuden pikaraitiotien ja isojen väylien varrella.

Työntekijöiden käytettävissä ovat hyvät työterveyspalvelut. Aalto-yliopisto tarjoaa monipuolisen koulutus ja kurssitarjonnan henkilöstölleen ja kannustaa henkilöstöään osallistumaan niihin. Aalto-yliopiston jäsenenä saat myös liikuntapalveluita henkilöstöhinnalla Unisportilta ja lounastat lukuisissa kampusravintoloissa henkilöstöhinnalla.

Tehtävän palkkaus määräytyy Aalto-yliopistossa käytössä olevan yliopistojen palkkausjärjestelmän mukaisesti. Tohtoriopiskelijan aloituspalkka on noin 2746 € ja se nousee väitöskirjatyön ja jatko-opintojen etenemisen myötä (mm valmistuneet artikkelit, opinnot). Toivomme, että voit aloittaa tehtävässä mahdollisimman pian sopimuksen mukaan.

Kiinnostuitko? 

Jos innostuit tehtävästä ja haluat liittyä joukkoomme, lähetä seuraavat asiakirjat (PDF, englanniksi) rekrytointijärjestelmämme kautta ("Apply now!”) viimeistään 31.10.2024.

• Motivaatiokirje (kuvaa selkeästi kiinnostuksem kohteesi, miten voit edistää projektia ja miten täytät yllä mainitut vaatimukset)
• CV (max 2 sivua) mukaan lukien mahdollinen julkaisuluettelo
• Kopiot opintosuoritusotteesta ja tutkintotodistuksesta
• Vähintään kahden suosittelijan yhteystiedot

Huomaa: Aalto-yliopiston työntekijöiden tulee hakea tehtävää sisäisen HR-järjestelmämme Workdayn (sisäiset työpaikat) kautta käyttämällä olemassa olevaa Workday-käyttäjätiliään (ei avointen työpaikkojen ulkoisen verkkosivun kautta). Aalto-yliopiston opiskelijoiden ja vierailijoiden tulee hakea ulkopuolisina hakijoina henkilökohtaisella sähköpostiosoitteella (ei Aalto-sähköpostilla).

Lisätietoja tehtävästä antaa Assistant Prof. Jarno Mäkelä [email protected] ja hakujärjestelmästä Hr partner Jenni Ståhl (jenni.stahl at aalto.fi)

Aalto-yliopisto pidättää oikeuden perustelluista syistä jättää tehtävän avoimeksi, pidentää hakuaikaa, avata hakuprosessin uudelleen ja ottaa huomioon hakijat, jotka eivät ole jättäneet hakemusta hakuajan kuluessa.

Käymme hakemukset läpi ja saatamme kutsua sopivia hakijoita haastatteluun jo hakuaikana. Tavoitteenamme on läpinäkyvä ja tasapuolinen rekrytointiprosessi, joten kysy rohkeasti palautetta.