Aalto-universitetet deltar i flera internationella nätverk. De främsta nätverken som främjar doktorandernas rörlighet är Nordic Five Tech och Cluster. Dessa nätverk har allmänna ramavtal för doktorandsamarbete:

• Nordic Five Tech: Communication on PhD Collaboration and Joint Supervision
• Cluster: Dual Doctorate Framework Agreement

Universitetet deltar också i EUA-CDE, Europeiska universitetsförbundets råd för doktorandutbildning för att följa och bidra till en diskussion och framtagning av en policy på europeisk nivå.

Nationella nätverk för doktorandutbildning ger de medverkande universiteten ett ramverk för utbildningssamarbete. Nätverken arrangerar gemensamma seminarier, kurser, sommarkurser och evenemang och främjar även nätverkande och ökat kollegialt stöd mellan studenterna.

Aalto-universitetet samordnar följande nationella nätverk:

• Brain&Mind doctoral programme
• Doctoral training network in condensed matter and materials physics, CMMP
• Doctoral network in industrial engineering and management
• Doktorsnätverk inom energieffektivitet och -system
• Doctoral education network in nuclear science and technology
• Forest Bioeconomy Doctoral FDP Network
• Finnish doctoral education network in stochastics and statistics
• Laskennallisen kemian verkosto, LASKEM (Nätverket för beräkningskemi)
• Science, technology, engineering, arts&design mathematics: learning and educational technology - doctoral training networks, STEAM-LET
• Syntetisk biologi – Nätverk för högre utbildning – SynBio GEN
• Doctoral Education Network in Systems Analysis, Decision Making and Risk Management

Aalto-universitetet är partner i följande nätverk:

• Doctoral training network in electronics, telecommunications and automation, DELTA
• Doctoral training network of mathematics in engineering sciences
• Doctoral education network in atmospheric sciences
• Doctoral education network in electrical energy engineering
• Doctoral education network on intelligent systems, DENIS
• Nätverk för doktorandutbildning inom modern optik och fotonik
• Graduate School in Chemical Engineering (GSCE)
• KATAJA
• Inforte
• Infotech
• International doctoral programme in biomedical engineering and medical physics
• Helsinki doctoral education network in information and communications technology, HICT
• Nationellt doktorandnätverk inom aktuell mekanisk teknik CME
• National doctoral network in informational and structural biology (ISB)